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转录组不求人系列(十三): GO、KEGG富集个性化作图
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当富集分析完成，拿到如下的分析结果后，就可以进行作图了。 富集分析结果的可视化无非就是柱状图和气泡图，但是公司默认出图实在是太丑，所以还是自己动手修改修改。 一、常规柱状图（ggplot2）横轴为gene counts…
三、上下调同时展示（ggplot2） 很多时候研究者拿到差异基因后，上下调基因是分别富集的，在展示上需要同时体现二者，我们之前提到metascape可以做到：转录组不求人系列(十二): Cell文章最喜欢用的差异基因GO、KEGG富集分析工具，除此之外，之前讲过的气泡图也可以展现多组的结果：复现《nature ...
转录组不求人系列(十三): go、kegg富集个性化作图. 当富集分析完成，拿到如下的分析结果后，就可以进行作图了。 富集分析结果的可视化无非就是柱状图和气泡图，但是公司默认出图实在是太丑，所以还是自己动...
那么得到转录水平的差异表达基因后，除了对单个基因进行实验研究，还可以进一步进行富集分析，从而对差异基因集中所在的功能集、通路集、基因集以及基因和它们之间的关系进行研究，这就是GO分析、KEGG分析、GSEA分析的内涵。 GO(Gene Ontology)是基因本体联合 ...
莎莎写于2020.5.2这是5月坚持的第2天，要一直坚持写啊，加油! 差异基因的功能注释和富集分析: • GO和KEGG富集分析• 基因集富集分析 MsigDB数据库 G...
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富集性分析是各组学进行数据分析的必备分析项，其中，尤以go和kegg富集因子图最为常见，见封面图。这张图非常经典，相比于其他富集分析结果，它包含了基因数目、 p值 和富集因子三个维度的信息量，更全面，更能辅助下结论。 得到这张图有两种方式： 1.
文章浏览阅读3.6k次，点赞21次，收藏31次。转录组数据分析之一，先介绍相关基础知识，其次用实际案例为基础，由浅入深介绍GO+KEGG富集分析全过程，包括内容有相关代码和截屏。_kegg通路富集分析
单细胞测序中go、kegg、gsea分析是三种常用的高级分析方法，它们各有特点和应用场景，以下是它们的主要区别： GO分析 1.定义与目的： Gene Ontology（GO）是一个国际标准化的基因功能分类系统，旨在对基因和蛋白质的功能进行限定和描述。
在进行差异基因表达分析时，得到显著差异基因后，接下来就需要分析这些基因参与了哪些功能，常见的就是go功能注释和kegg通路富集分析，今天为大家介绍在线分析工具的使用——david与kob